| 序号 | 项目类型 | 项目（课题名称） | 编号 | 负责人及单位 | 起止时间 |
| 1 | 973计划 | 微生物脱硫与吸附脱硫 | 2006CB202507 | 邢建民 : 中国科学院过程工程研究所 | 2006-01:2011-12 |
| 2 | 973计划 | 非常规冶金过程模拟,多尺度量化放大与工业生态技术优化集成方法及设计 | 2007CB613507 | 刘会洲 : 中国科学院过程工程研究所 | 2007-07:2011-07 |
| 3 | 973计划 | 生物炼制细胞工厂的科学基础 | 2007CB707802 | 康瑞娟 : 天津大学 | 2007-05:2012-12 |
| 4 | 973计划 | 丁醇发酵—渗透汽化分离耦合过程的关键技术研究 | 2007CB714300 | 万印华 : 中国科学院过程工程研究所 | 2007-07:2012-06 |
| 5 | 973计划 | 大规模培养细胞群体效应 | 2007CB714301 | 刘春朝 : 中国科学院过程工程研究所 | 2007-07:2011-07 |
| 6 | 973计划 | 工业生物过程单元耦合与集成 | 2007CB714305 | 苏志国 : 北京化工大学 | 2007-07:2010-08 |
| 7 | 973计划 | 工业生物过程的系统控制与优化 | 2007CB714306 | 石绍渊 : 江南大学 | 2007-07:2012-06 |
| 8 | 973计划 | 新一代生物催化和生物转化的科学基础（生物催化剂的环境适应机制研究） | 2009CB724705 | 马光辉 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-01:2013-08 |
| 9 | 973计划 | 纳米技术改善难溶性药物功效的应用基础研究（纳米技术增加难溶药物功效的生物安全性研究） | 2009CB930300 | 马光辉 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-01:2013-08 |
| 10 | 973计划 | 微生物槽浸体系反应工程的基础研究 | 2010CB630904 | 杨超 : 中国科学院过程工程研究所 | 2010-01:2014-12 |
| 11 | "863"计划 | 乳酸的生物炼制技术 | 2006AA020102 | 丛威 : 中国科学院微生物研究所 | 2006-12:2010-12 |
| 12 | "863"计划 | 谷氨酸发酵高产菌种选育和过程优化控制技术 | 2006AA020301 | 丛威 : 江南大学 | 2006-12:2010-12 |
| 13 | "863"计划 | 用于兽药残留检测的均一分子印迹微球制备及应用 | 2006AA10Z437 | 雷建都 : 中国科学院过程工程研究所 | 2006-12:2010-10 |
| 14 | "863"计划 | 紫杉醇规模化细胞生产关键技术 | 2007AA021501 | 刘春朝 : 中国科学院过程工程研究所 | 2007-01:2010-12 |
| 15 | "863"计划 | 分离纯化装备介质 | 2007AA021603 | 马光辉 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-01:2010-12 |
| 16 | "863"计划 | 核酸和多肽药物修饰及剂型化技术研究 | 2007AA021604 | 苏志国 : 中国科学院过程工程研究所 | 2007-06:2010-12 |
| 17 | "863"计划 | 工业发酵超滤－纳滤集成技术研究 | 2007AA02Z202 | 万印华 : 中国科学院过程工程研究所 | 2007-06:2010-12 |
| 18 | "863"计划 | 微生物燃料电池及废水发电关键技术 | 2007AA05Z158 | 李浩然 : 中国科学院过程工程研究所 | 2007-01:2010-12 |
| 19 | "863"计划 | 难处理金精矿高效生物浸矿反应器的研制 | 2007AA060904 | 杨超 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-01:2010-12 |
| 20 | "863"计划 | 高附加值壳聚糖微球的开发及应用 | 2007AA09Z439 | 王连艳 : 中国科学院过程工程研究所 | 2007-08:2010-07 |
| 21 | "863"计划 | 重组蛋白纯化工艺、安全和功能评价规范 | 2007AA100506 | 罗坚 : 中国疾病预防控制中心 | 2007-08:2010-01 |
| 22 | "863"计划 | 饲料用抗菌肽的分子改良与产品研制 | 2007AA100602 | 丛威 : 中国农业大学 | 2008-01:2010-12 |
| 23 | "863"计划 | 高强度和高密度发酵生产L-乳酸关键技术 | 2007AA10Z360 | 丛威 : 北京化工大学 | 2007-01:2010-12 |
| 24 | "863"计划 | 新型纳米纤维酶膜反应器的构建和界面酶催化转糖苷化反应 | 2008AA1OZ302 | 张松平 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-03:2010-11 |
| 25 | "863"计划 | 木糖醇清洁生产 | 2009AA02Z202 | 邱卫华 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-01:2011-12 |
| 26 | "863"计划 | 富含纤维发酵残渣制备功能材料及其对燃料生物脱硫 | 2009AA02Z209 | 刘春朝 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-01:2011-12 |
| 27 | "863"计划 | 年处理1500吨高含盐赖氨酸废水近零排放中试关键技术 | 2009AA033006 | 石绍渊 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-05:2010-12 |
| 28 | "863"计划 | 功能性食品关键技术研究与开发 | 2010AA023005 | 张贵锋 : 同仁堂 | 2010-01:2012-12 |
| 29 | 国家科技支撑计划 | 复杂贫锰矿高效选冶技术研究 | 2006BAB02A11 | 周光华 : 长沙矿冶研究院 | 2006-01:2010-12 |
| 30 | 国家科技支撑计划 | 海洋微藻高效培养工程化技术集成示范 | 2006BAD09A12 | 康瑞娟 : 乳山禧丰达渔业新技术有限公司 | 2006-01:2010-12 |
| 31 | 国家科技支撑计划 | 周期变压生物反应器的研制 | 2006BAD10B05 | 张小勇 : 南京土壤所 | 2006-01:2010-12 |
| 32 | 国家科技支撑计划 | 秸秆预处理改性工艺、设备与生物菌剂开发 | 2007BAD39B01 | 付小果 : 中国科学院过程工程研究所 | 2007-09:2011-12 |
| 33 | 国家科技重大专项 | 蛋白质的微生物发酵与分离纯化技术 | 2008BAI63B05 | 马光辉 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-05:2010-12 |
| 34 | 国家科技重大专项 | 大豆深加工行业清洁生产关键技术与示范工程子课题 | 2008ZX07207-003-35 | 李春 : 北京理工大学 | 2008-01:2011-12 |
| 35 | 国家科技重大专项 | 防病毒疫苗的高效粘膜给药载体的制备及应用研究 | 2008ZXJ9003-001 | 马光辉 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-10:2010-12 |
| 36 | 国家科技重大专项 | PEG化重组人粒细胞集落刺激因子的研究 | 2009ZX09102-239 | 刘永东 : 北京双鹭药业股份有限公司 | 2009-01:2010-12 |
| 37 | 国家科技重大专项 | 生物技术新药中试放大及分离纯化技术平台 | 2009ZX09306-005 | 苏志国 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-01:2010-12 |
| 38 | 国家自然科学基金 | 天然生物活性物质分离新方法和基础研究 | 20636010 | 苏志国 : 北京化工大学 | 2007-01:2010-12 |
| 39 | 国家自然科学基金 | 双功能温敏微球的制备及在蛋白质组学中的应用研究 | 20706053 | 王玉霞 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-01:2010-12 |
| 40 | 国家自然科学基金 | 流动式微量热法研究蛋白质在层析柱上的变构机理 | 20706054 | 张松平 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-01:2010-12 |
| 41 | 国家自然科学基金 | 纳米尺度多酶催化工程的研究 | 20728607 | 王平 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-01:2010-12 |
| 42 | 国家自然科学基金 | 结构可控的内嵌式荷电分子筛-硅橡胶杂化耐溶剂纳滤膜的研究 | 20806084 | 苏仪 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-01:2011-12 |
| 43 | 国家自然科学基金 | 蛋白质层析纯化中的失活机理及新型抗失活介质的制备 | 20820102036 | 马光辉 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-01:2012-12 |
| 44 | 国家自然科学基金 | 应用智能磁性层析介质的磁场流化层析技术 | 20876158 | 刘春朝 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-01:2011-12 |
| 45 | 国家自然科学基金 | 微生物燃料电池电子传递机制 | 20876160 | 李浩然 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-01:2011-12 |
| 46 | 国家自然科学基金 | 层析介质孔结构的原位表征和蛋白质的吸附保留 | 20906092 | 李秀男 : 中国科学院过程工程研究所 | 2010-01:2012-12 |
| 47 | 国家自然科学基金 | 微环境对病毒衣壳蛋白-脂类组装体在固体表面上结构变化的影响 | 20906093 | 李岩 : 中国科学院过程工程研究所 | 2010-01:2012-12 |
| 48 | 国家自然科学基金 | 动态吸附膜和静态吸附膜集成技术用于多组分分离的研究 | 20976175 | 万印华 : 中国科学院过程工程研究所 | 2010-01:2010-12 |
| 49 | 国家自然科学基金 | 氢交换和液质联用研究助溶剂影响蛋白质动态折叠及聚集机理 | 20976178 | 刘永东 : 中国科学院过程工程研究所 | 2010-01:2012-12 |
| 50 | 国家自然科学基金 | 基于微流控装置的均一分子印迹微球的组合合成研究 | 20976179 | 雷建都 : 中国科学院过程工程研究所 | 2010-01:2012-12 |
| 51 | 国家自然科学基金 | 多相反应体系中微纳尺度下混合、传递与反应协同机理 | 20990224 | 杨超 : 中国科学院过程工程研究所 | 2010-01:2013-12 |
| 52 | 国家自然科学基金 | 以纳米纤维为支撑的新型多酶催化体系用于生物制备过程的研究 | 20996180 | 张松平 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-11:2012-12 |
| 53 | 国家自然科学基金 | 红平红球菌摄取二苯并噻吩的机制及调控研究 | 30970046 | 邢建民 : 中国科学院过程工程研究所 | 2010-01:2012-12 |
| 54 | 国家自然科学基金 | 尺寸均一、可控的自发荧光壳聚糖纳微球制备和应用 | 50703043 | 王连艳 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-01:2010-12 |
| 55 | 省部级项目 | 天然油脂多维生物催化制造化学品和材料 | 06 2701 | 王平 : 中国科学院过程工程研究所 | 2006-09:2011-09 |
| 56 | 省部级项目 | 硫酸镁热解制氧化镁工艺研究 | 2007-g-150 | 李浩然 : 中国科学院过程工程研究所 | 2007-01:2010-12 |
| 57 | 省部级项目 | 真菌杀虫剂 | 2009-J-202-2-01-D03 | 陈洪章 : 中国科学院过程工程研究所 | 2010-09:2011-12 |
| 58 | 省部级项目 | 秸秆半纤维发酵丁醇及其综合利用技术与示范 | 2010SYZ0047 | 陈洪章 : 中国科学院过程工程研究所 | 2010-11:2012-09 |
| 59 | 省部级项目 | 基于微流控反应器的均一分子印迹微球制备及应用研究 | 2092027 | 雷建都 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-01:2011-12 |
| 60 | 省部级项目 | 磁性层析介质的制备与应用 | 2102041 | 刘春朝 : 中国科学院过程工程研究所 | 2010-01:2013-12 |
| 61 | 省部级项目 | 生物技术药新型载体及制剂研究关键技术 | 4.9201E+14 | 马光辉 : 中国科学院过程工程研究所 | 2010-09:2013-09 |
| 62 | 省部级项目 | 食品中明胶溯源检测关键技术研究 | 7102108 | 张贵锋 : 中国科学院过程工程研究所 | 2010-01:2012-12 |
| 63 | 省部级项目 | 新型药物可控缓释材料 | KGCX2-YW-210-1 | 马光辉 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-05:2011-04 |
| 64 | 省部级项目 | 光生物反应器研制与培养过程优化 | KGCX2-YW-223-2 | 丛威 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-01:2010-12 |
| 65 | 省部级项目 | 新型纤维素酶复合制剂制备技术的研究 | KGCX2-YW-328-1 | 邱卫华 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-09:2010-12 |
| 66 | 省部级项目 | 生物量全利用高值化集成技术的研究 | KGCX2-YW-328-2 | 彭小伟 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-09:2010-12 |
| 67 | 省部级项目 | 固相酶解发酵分离耦合乙醇改造和放大技术的研究 | KGCX2-YW-328-3 | 李宏强 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-09:2010-12 |
| 68 | 省部级项目 | 木质纤维原料发酵联产氢气和甲烷的关键技术 | KGCX2-YW-337 | 刘春朝 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-01:2010-12 |
| 69 | 省部级项目 | 光生物反应器技术 | KGCX2-YW-374-4 | 丛威 : 青岛生物能源与过程研究所 | 2009-06:2010-12 |
| 70 | 省部级项目 | 新疆棉杆资源清洁高值化利用关键技术研究与示范 | KGCX2-YW-502 | 张小勇 : 中国科学院过程工程研究所 | 2006-07:2010-07 |
| 71 | 省部级项目 | 新型药用纳米材料与纳米药物的研究 | KJCX2.YW.nano02 | 马光辉 : 中国科学院过程工程研究所 | 2006-10:2010-07 |
| 72 | 省部级项目 | 木质纤维素预处理过程与优化分析 | KSCX1-YW-11A1 | 陈洪章 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-01:2011-12 |
| 73 | 省部级项目 | 木质纤维素的高效水解工艺 | KSCX1-YW-11A2 | 邢建民 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-01:2011-12 |
| 74 | 省部级项目 | 乙醇发酵过程的系统集成与控制 | KSCX1-YW-11D | 万印华 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-01:2011-12 |
| 75 | 省部级项目 | 纤维素乙醇发酵过程优化与控制，中科院知识创新工程重大项目 | KSCX1-YW-11D1 | 刘春朝 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-01:2011-12 |
| 76 | 省部级项目 | 用转基因小球藻生产兔防御素的关键技术研究 | KSCX2-YW-R-2 | 刘春朝 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-01:2011-12 |
| 77 | 省部级项目 | 纤维素乙醇炼制 | O821024102 | 苏志国 : 中国科学院过程工程研究所 | 2007-01:2010-12 |
| 78 | 省部级项目 | "百人计划"择优支持 | O824011356 | 胡涛 : 中国科学院过程工程研究所 | 2010-09:2013-12 |
| 79 | 省部级项目 | PEG（聚乙二醇）修饰蛋白质药物技术及产业化 | TJZX2-YW-12 | 苏志国 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-03:2010-12 |
| 80 | 省部级项目 | 快速膜乳化器 | YZ200816 | 马光辉 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-09:2010-08 |
| 81 | 省部级项目 | 数控化微藻培养设备 | YZ200947 | 刘春朝 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-01:2011-12 |
| 82 | 省部级项目 | 新型乙肝疫苗－汉逊酵母的大规模分离纯化高技术产业化 | 发改办高计[2009]2822号 | 苏志国 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-01:2011-12 |
| 83 | 省部级项目 | 生物大分子过程工程 | 过程所创新团队 | 苏志国 : 中国科学院过程工程研究所 | 2010-01:2012-12 |
| 84 | 省部级项目 | 国家科技奖励-尺寸均一、可控的乳液、微球和微囊的制备技术 | 无 | 马光辉 : 中国科学院过程工程研究所 | 2008-10:2010-12 |
| 85 | 省部级项目 | 秸秆生态板材产生技术与示范 | 院地合作 | 彭小伟 : 中国科学院过程工程研究所 | 2010-10:2012-09 |
| 86 | 省部级项目 | 苎麻汽爆脱胶技术与产业化示范 | 院地合作1 | 陈洪章 : 中国科学院过程工程研究所 | 2010-12:2012-09 |
| 87 | 省部级项目 | 尺度均一的纳米球快速制备装置 | 院级项目编码+流水[2] | 马光辉 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-01:2010-12 |
| 88 | 省部级项目 | 太阳能光热驱动海水淡化技术 | 中国科学院创新工程试点 | 万印华 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-07:2011-07 |
| 89 | 省部级项目 | 纤维素乙醇发酵的生物过程工程 | 中科院知识创新重大项目 | 万印华 : 中国科学院过程工程研究所 | 2009-06:2013-06 |
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